Finales de mayo de 1871. El capitán Nemo acude a la ciudad de París en poder de la Comuna en busca del profesor Aronnax. Nemo ha establecido contacto con un ser de pesadilla que lleva millones de años acechando bajo el mar y necesita al zoólogo especializado en monstruos marinos para poder romper ese contacto y salvar el mundo. Será el principio de una carrera contra reloj que los llevará hasta la universidad de Miskatonic, en Arkham, y acabará en la ciudad perdida de R'lyeh, dónde Cthulhu espera desde hace eones el momento de levantarse y desatar el caos.